Home Biophysico-chimie structurale Modélisation et dynamique moléculaire
Modélisation et dynamique moléculaire

Prestations et domaines d’expertises

  • Dynamique moléculaire d'assemblages supramoléculaires
  • Drug design de molécules actives (inhibiteurs et activateurs) dans des processus biologiques complexes

 

Equipements

Cluster IBM de 66 processeurs Intel Xeon 2.8Ghz et 17 Go de RAM:

  • 1 lame transtec de 4 Octo-core AMD Opteron Processor 6136 à 2.4Ghz et 256Go de RAM
  • 1 lame transtec de 2 Dodeca-core AMD Opteron Processor 6168 à 1.9Ghz et 32 Go de RAM
  • 2 lames Advanced Capacities de 4 Dodeca-core AMD Opteron Processor 6168 à 1.9Ghz et 64 Go de RAM
  • 3 lames Transtec de 4 dodeda-core AMD Opteron Processor 6172 à 2.1Ghz et 64 Go de RAM

Autre:

  • Serveur de stockage de type DAS de 162 To brutes en raid 6 - sert à centraliser les résultats des calculs sur une période de 3 à 5 ans maxi.

Logiciels:

  • Logiciels de Dynamique Moléculaire installés : GROMACS, NAMD, AMBER, CHARMM et DESMOND de Schrödinger Inc.
  • Logiciels de Chimie Moléculaire et de Drug-Design/Docking : DOCK, AUTODOCK, VINA + licence de groupe pour MacroModel de Schrödinger Inc. et nombreuses licences et modules de Discovery Studio 2.1 de Accelrys Inc.
  • Logiciels développés en interne (Lipophilie Moléculaire, tri de bases de protéines, ...)

Accès

Responsable technique et expertise scientifique

Michel Laguerre Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir.

 
Centre de gnomique fonctionnel de Bordeaux - Biologie Structurale
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Institut Européen de Chimie et Biologie
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